Introdução: Descrito pela primeira vez em 1950, o sistema de grupo sanguíneo Duffy é caracterizado por uma glicoproteína (ACKR1) expressa na membrana celular dos eritrócitos, bem como em outros tecidos. Indivíduos que possuem o polimorfismo rs2814778 no gene ACKR1 apresentam um fenótipo Fya e Fyb negativo (Duffy-null), frequentemente relacionado a neutropenia étnica benigna, embora este mecanismo ainda não esteja completamente esclarecido. Por esse motivo, a avaliação deste fenótipo deve fazer parte do roteiro de investigação dos pacientes com neutropenia, sobretudo naqueles em que há suspeita de neutropenia étnica benigna. Objetivos: Correlacionar a fenotipagem por técnica imuno-hematológica dos antígenos Fya e Fyb, a genotipagem para o sistema Duffy e a presença do polimorfismo rs2814778 em pacientes neutropênicos, de modo a definir se apenas a fenotipagem é suficiente para a determinação do fenótipo Duffy-null, em pacientes portadores de neutropenia. Métodos: Trata-se de um estudo transversal incluindo 41 pacientes, 28 adultos e 13 pediátricos atendidos no período de dois anos no Ambulatório de Neutropenias da Disciplina de Hematologia e Hemoterapia da Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). As amostras foram submetidas a fenotipagem dos antígenos Fya e Fyb, genotipagem do gene ACRK1 e a pesquisa do polimorfismo rs2814778. Resultados: Do total de pacientes analisados, 31,70% apresentavam idade < 18 anos (pediátricos) e 68,29% ≥ 18 anos (adultos). Dentre o grupo de pacientes pediátricos, a prevalência do fenótipo Duffy-null foi de 61,53%, enquanto no grupo de pacientes adultos foi de 82,14%. Considerando o total de pacientes, a prevalência do fenótipo foi de 75,60%. Quando comparados os testes imuno-hematológicos e moleculares, 97,46% apresentaram resultados concordantes e apenas um paciente (2,54%) apresentou resultado discrepante, demonstrando alta correlação entre as técnicas (coeficiente κ = 0,935). Considerando estes dados, pode-se observar que a fenotipagem para o sistema Duffy apresentou sensibilidade de 100%, especificidade de 90% e acurácia de 97%. Discussão: A pesquisa do fenótipo Duffy-null é um passo essencial na investigação de pacientes portadores de neutropenia. Embora a fenotipagem do sistema Duffy por métodos imuno-hematológicos seja amplamente disponível na maior parte dos serviços, a genotipagem apresenta custo mais elevado e pode não ser acessível. A alta concordância entre as técnicas analisadas demonstrou segurança na realização apenas dos testes imuno-hematológico para determinação do fenótipo Fya e Fyb, sem que seja necessária a realização de análise genética, rotineiramente, na população neutropênica. Conclusão: A concordância obtida entre os testes realizados foi alta, demonstrando que a fenotipagem do sistema Duffy aparenta ser um teste sensível e acurado para a determinação do fenótipo Duffy-null nos pacientes portadores de neutropenia.