HLA Associations in Classical Hodgkin Lymphoma: EBV Status Matters
pmid: 22808081
pmc: PMC3393726
HLA Associations in Classical Hodgkin Lymphoma: EBV Status Matters
La pathogenèse du lymphome hodgkinien classique (LHc) implique des facteurs environnementaux et génétiques. Pour explorer le rôle des gènes de l'antigène leucocytaire humain (HLA), nous avons réalisé une étude de génotypage cas-témoins chez 338 patients néerlandais atteints de LHc en utilisant une approche d'hybridation par sonde oligonucléotidique spécifique à la séquence (SSOP) basée sur la PCR. Les fréquences alléliques ont été comparées aux typages HLA de plus de 6 000 témoins. L'âge des patients atteints de LHc variait entre 13 et 81 ans avec une médiane de 35 ans. Le sous-type de sclérose nodulaire était le sous-type le plus fréquent (87 %) et le VEB a été détecté chez 25 % des patients atteints de LHc. HLA-B5 était significativement augmenté et HLA-DR7 diminuait significativement dans la population totale de patients atteints de LHc par rapport aux témoins. Deux associations de classe II ont été observées comme étant spécifiques pour la population EBV− cHL avec une augmentation de HLA-DR2 et HLA-DR5. Les fréquences des allèles de HLA-A1, HLA-B37 et HLA-DR10 étaient significativement augmentées dans la population EBV+ cHL ; ces allèles sont en fort déséquilibre de liaison et forment un haplotype commun chez les Caucasiens. La fréquence des allèles de HLA-A2 était significativement diminuée dans la population EBV+ cHL. L'analyse des haplotypes avec une fréquence >1% a révélé une augmentation significative de HLA-A2-B7-DR2 dans EBV− cHL par rapport aux témoins. L'analyse de l'association SSOP a révélé des différences significatives entre les patients EBV+ et EBV− cHL pour 19 sondes qui discriminent entre HLA-A*01 et HLA-A*02. En conclusion, les antigènes HLA-A1 et HLA-A2 et non des variants nucléotidiques uniques spécifiques partagés par des allèles multiples sont responsables de l'association avec EBV+ cHL. En outre, plusieurs nouvelles associations HLA protectrices et prédisposantes de classe I et II pour l'EBV+, l'EBV− et l'ensemble de la population cHL ont été identifiées.
La patogénesis del linfoma de Hodgkin clásico (LHc) implica factores ambientales y genéticos. Para explorar el papel de los genes del antígeno leucocitario humano (HLA), realizamos un estudio de genotipado de casos y controles en 338 pacientes holandeses con cHL utilizando un enfoque de hibridación de sonda oligonucleotídica específica de secuencia (SSOP) basado en PCR. Las frecuencias alélicas se compararon con los tipos de HLA de más de 6.000 controles. La edad de los pacientes con cHL varió entre 13 y 81 años con una mediana de 35 años. El subtipo de esclerosis nodular fue el subtipo más común (87%) y se detectó EBV en el 25% de los pacientes con cHL. HLA-B5 aumentó significativamente y HLA-DR7 disminuyó significativamente en la población total de pacientes con cHL en comparación con los controles. Se observó que dos asociaciones de clase II eran específicas para la población EBV− cHL con un aumento de HLA-DR2 y HLA-DR5. Las frecuencias de alelos de HLA-A1, HLA-B37 y HLA-DR10 aumentaron significativamente en la población EBV+ cHL; estos alelos están en fuerte desequilibrio de ligamiento y forman un haplotipo común en caucásicos. La frecuencia alélica de HLA-A2 disminuyó significativamente en la población EBV+ cHL. El análisis de haplotipos con una frecuencia de >1% reveló un aumento significativo de HLA-A2-B7-DR2 en EBV− cHL en comparación con los controles. El análisis de asociación de SSOP reveló diferencias significativas entre los pacientes con EBV+ y EBV− cHL para 19 sondas que discriminan entre HLA-A*01 y HLA-A*02. En conclusión, los antígenos HLA-A1 y HLA-A2 y las variantes de un solo nucleótido no específicas compartidas por múltiples alelos son responsables de la asociación con EBV+ cHL. Además, se identificaron varias nuevas asociaciones protectoras y predisponentes de HLA de clase I y II para el EBV+, el EBV− y toda la población de cHL.
The pathogenesis of classical Hodgkin lymphoma (cHL) involves environmental and genetic factors. To explore the role of the human leukocyte antigen (HLA) genes, we performed a case-control genotyping study in 338 Dutch cHL patients using a PCR-based sequence-specific oligonucleotide probe (SSOP) hybridization approach. The allele frequencies were compared to HLA typings of more than 6,000 controls. The age of the cHL patients varied between 13 and 81 years with a median of 35 years. Nodular sclerosis subtype was the most common subtype (87%) and EBV was detected in 25% of the cHL patients. HLA-B5 was significantly increased and HLA-DR7 significantly decreased in the total cHL patient population as compared to controls. Two class II associations were observed to be specific for the EBV− cHL population with an increase of HLA-DR2 and HLA-DR5. Allele frequencies of HLA-A1, HLA-B37 and HLA-DR10 were significantly increased in the EBV+ cHL population; these alleles are in strong linkage disequilibrium and form a common haplotype in Caucasians. The allele frequency of HLA-A2 was significantly decreased in the EBV+ cHL population. Analysis of haplotypes with a frequency of >1% revealed a significant increase of HLA-A2-B7-DR2 in EBV− cHL as compared to controls. SSOP association analysis revealed significant differences between EBV+ and EBV− cHL patients for 19 probes that discriminate between HLA-A*01 and HLA-A*02. In conclusion, the HLA-A1 and HLA-A2 antigens and not specific single nucleotide variants shared by multiple alleles are responsible for the association with EBV+ cHL. Furthermore several new protective and predisposing HLA class I and II associations for the EBV+, the EBV− and the entire cHL population were identified.
ينطوي التسبب في سرطان الغدد الليمفاوية هودجكين الكلاسيكي (CHL) على عوامل بيئية ووراثية. لاستكشاف دور جينات مستضد الكريات البيض البشرية (HLA)، أجرينا دراسة التنميط الجيني للتحكم في الحالة في 338 مريضًا هولنديًا من القانون الإنساني الدولي باستخدام نهج تهجين مسبار أوليجو نوكليوتيد محدد بالتسلسل (SSOP) القائم على تفاعل البوليميراز المتسلسل. تمت مقارنة ترددات الأليل بكتابات HLA لأكثر من 6000 عنصر تحكم. تراوح عمر مرضى تشل بين 13 و 81 سنة بمتوسط 35 سنة. كان النوع الفرعي للتصلب العقدي هو النوع الفرعي الأكثر شيوعًا (87 ٪) وتم اكتشاف فيروس إيبولا في 25 ٪ من مرضى التهاب الكبد الوبائي. تم زيادة HLA - B5 بشكل كبير وانخفض HLA - DR7 بشكل كبير في إجمالي عدد المرضى المصابين بالتهاب الكبد التقرحي مقارنة بالضوابط. لوحظ وجود رابطتين من الفئة الثانية خاصتين بسكان EBV- cHL مع زيادة HLA - DR2 و HLA - DR5. زادت الترددات الأليلية لـ HLA - A1 و HLA - B37 و HLA - DR10 بشكل كبير في مجموعة EBV+ cHL ؛ هذه الأليلات في اختلال قوي في الارتباط وتشكل نمطًا فردانيًا شائعًا في القوقازيين. انخفض تواتر أليل HLA - A2 بشكل كبير في مجموعة EBV+ cHL. كشف تحليل الأنماط الفردانية بتواتر >1 ٪ عن زيادة كبيرة في HLA - A2 - B7 - DR2 في EBV- cHL مقارنة بالضوابط. كشف تحليل ارتباط SSOP عن اختلافات كبيرة بين مرضى EBV+ و EBV- cHL لـ 19 تحقيقًا تميز بين HLA - A*01 و HLA - A*02. في الختام، فإن مستضدات HLA - A1 و HLA - A2 وليس متغيرات نوكليوتيد مفردة محددة تشترك فيها أليلات متعددة هي المسؤولة عن الارتباط مع EBV+ cHL. علاوة على ذلك، تم تحديد العديد من ارتباطات HLA الجديدة الواقية والمهيأة من الفئة الأولى والثانية لـ EBV+ و EBV - وجميع سكان cHL.
- Peking University China (People's Republic of)
- Peking University China (People's Republic of)
- University Medical Center Groningen Netherlands
- Drug Abuse Resistance Education United States
- Institute of Cancer Research United Kingdom
Male, Herpesvirus 4, Human, Regulatory T Cell Development and Function, PROTEIN, EPITOPE, SUSCEPTIBILITY, Gene, DISEASE, Linkage Disequilibrium, Gene Frequency, HLA Antigens, CLASS-I, NASOPHARYNGEAL CARCINOMA, Haplotype, EPIDEMIOLOGY, EPSTEIN-BARR-VIRUS, Aged, 80 and over, Immunology and Microbiology, Allele, Allele frequency, Human leukocyte antigen, Histocompatibility Testing, Q, R, Life Sciences, Middle Aged, Hodgkin Disease, Environmental health, Antigen, Medicine, Female, Research Article, Adult, Genotyping, Adolescent, Genotype, Science, Immunology, Population, White People, Pathology and Forensic Medicine, Health Sciences, Linkage disequilibrium, Genetics, Humans, Infectious Mononucleosis, GENOME-WIDE ASSOCIATION, Lymphoid Neoplasms, Biology, Alleles, Aged, FOS: Clinical medicine, Gene Expression Profiling, ALLELES, Haplotypes, Case-Control Studies, FOS: Biological sciences, Natural Killer Cells in Immunity
Male, Herpesvirus 4, Human, Regulatory T Cell Development and Function, PROTEIN, EPITOPE, SUSCEPTIBILITY, Gene, DISEASE, Linkage Disequilibrium, Gene Frequency, HLA Antigens, CLASS-I, NASOPHARYNGEAL CARCINOMA, Haplotype, EPIDEMIOLOGY, EPSTEIN-BARR-VIRUS, Aged, 80 and over, Immunology and Microbiology, Allele, Allele frequency, Human leukocyte antigen, Histocompatibility Testing, Q, R, Life Sciences, Middle Aged, Hodgkin Disease, Environmental health, Antigen, Medicine, Female, Research Article, Adult, Genotyping, Adolescent, Genotype, Science, Immunology, Population, White People, Pathology and Forensic Medicine, Health Sciences, Linkage disequilibrium, Genetics, Humans, Infectious Mononucleosis, GENOME-WIDE ASSOCIATION, Lymphoid Neoplasms, Biology, Alleles, Aged, FOS: Clinical medicine, Gene Expression Profiling, ALLELES, Haplotypes, Case-Control Studies, FOS: Biological sciences, Natural Killer Cells in Immunity
1,001 Research products, page 1 of 101
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
- 2017IsRelatedTo
chevron_left - 1
- 2
- 3
- 4
- 5
chevron_right
citations This is an alternative to the "Influence" indicator, which also reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).60 popularity This indicator reflects the "current" impact/attention (the "hype") of an article in the research community at large, based on the underlying citation network.Top 10% influence This indicator reflects the overall/total impact of an article in the research community at large, based on the underlying citation network (diachronically).Top 10% impulse This indicator reflects the initial momentum of an article directly after its publication, based on the underlying citation network.Top 10%
