As leucemias resultam de uma interação adversa entre gene-ambiente, com susceptibilidade condicionada, pelo menos em parte, por polimorfismos de múltiplos genes. Como a metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR) possui papel chave no metabolismo do folato, alterações na sua atividade (resultante de polimorfismos) ou alterações na suplementação de folato, podem influenciar na síntese, reparo e metilação de DNA. Neste estudo, determinamos a freqüência dos polimorfismos 677C>T e 1298A>C do gene MTHFR em 177 crianças menores de 16 anos com leucemias agudas (LA) de diversas regiões brasileiras e em 249 amostras de indivíduos normais como o grupo controle. O método utilizado para genotipagem foi PCR-RFLP. As freqüências dos genótipos 677CC, 677CT e 677TT foram 51%, 40% e 9% nos controles, 57%, 33% e 10% para os casos de leucemia linfoblástica aguda (LLA), e 49%, 39% e 12% para os casos de leucemia mielóide aguda (LMA), respectivamente. Já as freqüências dos genótipos 1298AA, 1298AC e 1298CC foram respectivamente 62%, 31% e 7% nos controles, 51%, 41% e 8% nos casos de LLA e, 67%, 31% e 2% nos casos de LMA, respectivamente. Quando comparamos casos de LLA com os controles, para o polimorfismo 677C>T, encontramos um OR= 0,7 (0,5 - 1,2) e OR= 1,0 (0,4 - 2,1) para os genótipos CT e TT, respectivamente. Para o polimorfismo 1298A>C, o OR foi 1,6 (1,0 - 2,5) e 1,3 (0,6- 3,0) para os genótipos AC e CC, respectivamente. Para os casos de LMA, o OR foi 1,0 (0,5 - 2,1) para o genótipo CT, e 1,3 (0,5 - 3,9) para o genótipo TT. Para o genótipo AC, encontramos um OR= 0,9 (0,4 - 1,9); para o genótipo CC, o OR foi 0,3 (0,04 - 2,3). Não houve diferenças entre as freqüências do MTHFR 677C>T e 1298A>C em ambos os grupos na análise global. Os resultados indicam que MTHFR 677C>T e 1298A>C não conferem efeito protetor contra a LA infantil.