Bajo el convenio de cooperación No. 22-007 entre Ecopetrol, Cenit y Bicentenario y el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt, se llevó a cabo el levantamiento de la Línea Base de Biodiversidad y Servicios Ecosistémicos para cuatro predios piloto de Ecoreservas en predios de Ecopetrol, Cenit y Bicentenario, ubicados en tres regiones del país. Este levantamiento incluyó el desarrollo de muestreos rápidos de biodiversidad para siete grupos biológicos y la recolección de sonidos en predios ubicados en los departamentos de Cundinamarca, Córdoba y Meta. Se realizaron muestreos de mamíferos pequeños (voladores y no voladores), medianos y grandes en sitios seleccionados dentro de los predios de la Ecoreserva, mediante el uso de redes de niebla, trampas de capturas y cámaras trampa, siguiendo métodos estándar de muestreo como se describe a continuación. Los muestreos se realizaron durante siete noches y ocho días netos. El presente conjunto de datos contiene 110 registros de mamíferos de la Ecoreserva Apiay (Villavicencio, Meta).