O Herbário Dr. Ary Tupinambá Pena Pinheiro foi fundado no dia 18 de outubro de 2002. Está situado na sede da faculdade São Lucas, e conta atualmente com 5.664 especimes da flora fanerogâmica, pertencentes à 127 famílias botânicas do sistema de Cronquist, havendo ainda, briófitas, fungos e pteridophytas. Atualmente o herbário ocupa uma área total com cerca de 53,62 m².; possui uma sala para o acervo e outra para a curadoria além de uma ante sala para manuseio de material e estufa. O Herbário dispõe ainda de uma biblioteca com várias obras, Dicionário de Plantas, além de periódicos, livros e teses diversas.