El flanco oriental de la Cordillera oriental (foCO) en Colombia, está catalogada como una de las áreas más importantes para la conservación de Los Andes de Colombia (IAvH 1996), a pesar de esto, muy poco se conoce acerca de la diversidad de reptiles de esta región. En marco de las expediciones Colombia Bio, organizadas y financiadas por COLCIENCIAS, se realizó un estudio de la composición de los reptiles de la transición andino-amazónica en el departamento del Caquetá, Colombia, especificamente en el municipio de Belen de los Andaquíes. Se realizaron muestreos en ocho estaciones en el foCO, que se encuentran desde los 400 m hasta los 2200 m de altitud aproximadamente, seis de las estaciones se encuentran dentro del Parque Municipal Natural Andaki. Los muestreos se realizaron entre el 22 de enero y el 8 de febrero de 2017. Se presenta una base de datos con los registros biológicos de los reptiles recolectados durante la Expedición Colombia Bio. Se obtuviero un total de 418 registros que corresponden a 41 especies.