No ano de 2003 foi criada a Coleção Científica de Mastozoologia da Universidade Federal do Paraná (CCMZ), com objetivo de realizar depósito de material coletado proveniente de diferentes estudos com mamíferos e propiciar futuros trabalhos desenvolvidos com o grupo. O acervo da coleção de Mammalia é constituído principalmente por exemplares das ordens Chiroptera, Rodentia, Primates e Didelphimorphia. Existe material depositado em via líquida, material taxidermizado, peles em postura científica e natural, assim como os crânios. A coleção tem material de 2746 espécimes de mamíferos depositados, sendo constatada a presença de 10 diferentes ordens. A riqueza na coleção é de 175 espécies, dentre as quais se observa a predominância de exemplares da ordem Chiroptera (n = 2251 espécimes), representando cerca de 82% da coleção. Para esta ordem há a presença de exemplares de 95 espécies diferentes, número este que corresponde à 54% da riqueza de espécies de morcegos que se tem registro para o Brasil e à 80% e 85% do número de espécies de morcegos registradas no sul do Brasil e no estado do Paraná, respectivamente. O restante dos espécimes distribuem-se entre as diferentes ordens, havendo uma predominância observada para a ordem Rodentia, com aproximadamente 15% (n = 417), seguida de Didelphimorphia, que apresenta cerca de 3% (n = 78) do número total de exemplares.