El objetivo de la colección consiste en desarrollar investigación científica sobre el origen, las interacciones, la distribución, la composición actual, el aprovechamiento y la conservación de la diversidad biológica presente en el departamento del Chocó, además de formar recursos humanos a nivel de postgrado, tendientes a proponer soluciones a los problemas de conservación y aprovechamiento de los recursos naturales en nuestro departamento.

La Colección de Herpetología, ha venido realizando inventarios de los ejemplares que están debidamente catalogados, con el fin de verificar que el material se encuentre en las mejores condiciones y estén debidamente documentados con todos los procesos que se requieren para la publicación de sus datos. Igualmente se han realizado inventarios del material disponible, procurando que se encuentre con la información necesaria y correspondiente.

El recurso de la Colección Científica de Referencia Zoológica de la Universidad Tecnológica del Chocó - Herpetología, cuenta con 3.810 registros biológicos (anfibios y reptiles), con ejemplares de otros departamentos de Colombia, siendo en su gran mayoría en el departamento del Chocó.