El Santuario de Flora y Fauna Galeras es un área protegida que conserva la biodiversidad natural de las especies de aves y garantiza la viabilidad a largo plazo de las poblaciones naturales, de igual manera apoya y promueve acciones y proyectos de conservación para la protección y monitoreo de las aves. Por tanto es de gran importancia para el Santuario continuar un proceso que permite evaluar el estado de conservación de los ecosistemas a través del monitoreo de poblaciones de aves, como parte del Programa de Monitoreo con que cuenta el área, principalmente en los ecosistemas alto andinos. El monitoreo ha brindado información base sobre el número de especies que se encuentran en el área protegida. A través de los registros de aves monitoreadas ha sido posible establecer, que las áreas presentan un buen estado de conservación ecosistémica, donde la avifauna encuentra las condiciones ambientales favorables que cubren los requerimientos y necesidades optimas para su permanencia, reproducción y conservación dentro del Santuario.

Es así como, se tiene por objetivo realizar un seguimiento a largo plazo de las especies de aves presentes en los ecosistemas de alta montaña del SFF Galeras, que permita evaluar el estado de las poblaciones y las presiones que afectan su conservación dentro del Santuario de Flora y Fauna Galeras. Esto por medio de la generación de la línea base de las especies de aves presentes en los ecosistemas de Páramo y Bosque alto andino del SFF Galeras y además identificando a las especies que se encuentran bajo algún criterio de amenaza. Es así como, desde 2009 hasta 2014 se han identificado 143 especies de aves, distribuidas en 102 géneros y 36 familias. Encontrándose que, la comunidad de aves en el Santuario se encuentra mejor representada por las familias Thraupidae, Trochilidae y Passerellidae. Y a su vez el ecosistema que presenta mayor diversidad de aves, es el bosque Altoandino, seguido por el bosque Andino y el Páramo.

El Santuario de Flora y Fauna Galeras por ser un área protegida ha logrado que sus tres ecosistemas (bosque andino, bosque alto andino y páramo) se encuentran en un importante estado de conservación y recuperación, donde los bosques alto andinos logran mantener las características bióticas necesarias para que las poblaciones de fauna y flora mantengan su flujo genético y garanticen de cierta manera su permanencia en estos ecosistemas. Sin embargo es fácil observar que a pesar de los diferentes programas desarrollados en la zona amortiguadora del Santuario, aún existen algunas presiones relacionadas a la extensión de la frontera agrícola, ganadera y la extracción de material vegetal, que causan vulnerabilidad a estos ecosistemas alto andinos que son protegidos y por consiguiente a las especies ahí presentes.