Los humedales del río Atrato albergan gran cantidad y variedad de especies faunísticas, las cuales presentan ciertos requerimientos ecológicos que solo encuentran en estos singulares ecosistemas, ya que factores como su comportamiento hidrológico (constantes inundaciones), la abundancia natural de oferta de recursos tróficos y habitacionales constituyen su hábitat propicio y le permiten establecerse. Dicha fauna además propician la ocurrencia de procesos ecológicos como la dispersión, polinización, reciclaje de nutrientes, depredación, descomposición, entre otros; al tiempo que permite la formación de cadenas tróficas complejas que facilitan la circulación de la energía y la materia a través del ecosistema. Todos estos elementos favorecen la generación de bienes y servicios ambientales que benefician a las comunidades asentadas en el área de influencia de estos humedales. Además de que la presencia de algunas especies faunísticas es un importante indicador de conectividad ecológica y del estado de conservación del ecosistema; razón por la cual es de vital importancia. Pese a las singulares características de estos ecosistemas y de la importante diversidad que albergan, han venido siendo fuertemente amenazados por actividades de origen antrópico como la minería, la caza y pesca con técnicas inadecuadas, el cambio de curso de los ríos, el vertimiento de sustancias contaminantes y los incendios ocasionales; las cuales afectan drásticamente la fauna, reduciendo sus poblaciones y desapareciendo su hábitat. Por lo anterior, es necesario seguir estudiando la fauna presente en estos ecosistemas, con el propósito de entender su diversidad y su dinámica, con lo cual se puedan buscar estrategias que dirijan a la conservación de tales ecosistemas